2018年7月7日，人类承受了一次史无前例的大灾难，人们称为“降临之日”，大批不明生物从某些人类的体内出现，对人类进行肆意的屠杀。剩下仅存的人类在世界范围内建起七座城市进行最后的抵抗以延续自己的文明。
    “黄雀”是一个自唐朝就存在的刺客组织，因为其有坚定的信仰而存在至今，此组织在灾难发生之前便与欧美的另外一个刺客组织“阴影”调查这些不明生物，但是并没有在灾难发生之前得出结果。
    二十二年后，刺客联盟发现一块史前留下的原型大碑石，在幸存下来的史学家考古学家的帮助下，成功破译里面的小部分文字。里面揭示了一个人类永远都不会相信的秘密——造物主与地狱来客的条约。石碑最重要的七部分却缺失了，为解开这个秘密，并使人类从这个几乎是毁灭性的灾难中从新复兴，作为刺客联盟中一员的付言，在危机重重的世界与同僚寻找着人类的最后希望并解开碑石中不为人知的巨大秘密...